Abrange ações que promovem a melhoria da qualidade de vida dos povos indígenas, bem como a redução de emissões de gases de efeito estufa por desmatamento e degradação, a diminuição do fluxo de carbono, o manejo florestal sustentável e a conservação, manutenção e aumento dos estoques de carbono florestal nas terras indígenas.
Os provedores do Subprograma Territórios Indígena são os povos indígenas de terras situadas no estado do Acre e todos aqueles que, com eles associados, e que estejam habilitados no SISA, que promovem ações legítimas para a redução de emissões de gases de efeito estufa oriundos de desmatamento e degradação, a diminuição do fluxo de carbono, o manejo florestal sustentável e a conservação, manutenção e aumento dos estoques de carbono florestal.
No período de 2018 a 2022 foram beneficiados diretamente 1.102 indígenas e 150 escolas indígenas da rede estadual de ensino, contribuindo com cerca de 3.601 alunos indígenas.